1. 重视“辨病为主、病证结合、专病专方”治疗相结合
根据疫病发病特点即某一疫病皆有相同症状，因此要求治疗的针对性。吴又可在《温疫论》中说“然则何以知其为疫? 盖脉证与盛行之年所患之症，纤悉相同，至于用药、取效，毫无差别”。因此要重视
“辨病为主、专病专方”。吴又可深刻指出:“一病只有一药之到而病自已，不烦君臣佐使品味加减之劳矣。”在把握疾病演变过程中主要证候的基础上进行辨证论治。
2. 重视体质因素
发病程度与感染毒株毒力强弱有关，但与体质强弱亦密切相关。
3. 要重视疫毒的病性
新型冠状病毒感染性肺炎是急性传染病，属于中医的疫毒，不等同于“四时温病”。立足点要针对“疫毒”的病理表现及特点，离开了“疫毒”就离开了主要病因。因此，发病过程中由毒而热、由毒而喘、由毒而瘀、由毒而脱、由毒而虚，从病机而论有湿毒、热毒、瘀毒等不同的病性，故治之当不离毒，“逐邪为第一要义”。《温疫论》对疫病的治则提出“大凡客邪贵乎早逐”“邪不去则病不愈”，强调“有邪必逐，除寇务尽”为其指导思想。
4. 要重视主要病变部位和主要证候
新型冠状病毒感染性肺炎病位主要在肺，除高热外，干咳、胸闷、气促乃至呼吸窘迫及肺实变体征都说明了这一点，其次伴有胃肠道症状，危重期多见多脏器损伤。
5. 要重视根据病情的迅速变化判断轻症、重症并作出相应处理
由于本病变化急骤，有的患者病情迅速加重，肺部多叶病变，重症新型冠状病毒感染性肺炎出现休克、多器官功能障碍综合征，因此很难以时间段分期，要重视轻症与重症判断，作出相应处理。
6. 根据新型冠状病毒感染性肺炎发病的特点，结合现代有关药理研究成果，提出针对该病临床演变规律的综合治疗方法
如不同病理阶段的治疗措施，早期截断扭转防止病情发展；后期扶持正气，预防肺间质病变；危重阶段配合西医抢救；如何减少抗生素与激素的副作用等，总结更新中医治疗方案。
